Fotbalistul născut la Nova Gradiska a debutat în fotbalul mare pentru Hajduk Split, atunci când, a bifat 5 minute în partida de campionat cu Slaven Belupo, din cadrul sezonului 2012-2013, fiind parte din echipa care a câștigat Cupa Croației în acel an. Ulterior, în stagiunea următoare (2013-2014), Mikanovic a jucat în 17 meciuri în toate competițiile pentru Hajduk, reușind să marcheze o dată și să livreze trei pase decisive. Dintre acestea, două assist-uri au venit în victoria cu echipa macedoneană Horizont (2-1), la debutul noului nostru jucător în preliminariile UEFA Europa League.

15 partide și o pasă de gol a fost bilanțul lui Mikanovic la Hajduk în stagiunea 2014-2015, pentru ca, în luna iulie a anului 2015, să fie transferat de danezii de la Aarhus. În primul sezon în țara nordică, fundașul lateral a strâns 23 de prezențe și a reușit să înscrie un gol, iar în următorul an competițional, 2016-2017, a jucat în 30 de partide pentru Aarhus, contribuind cu trei pase decisive. Mikanovic a mai evoluat pentru echipa daneză până în februarie 2019, reușind să mai acumuleze 54 de meciuri pentru aceasta formație, timp în care a contribuit cu cinci assist-uri.

Următoarea experiență l-a găsit pe fundașul croat în Kazahstan, la Kairat Almaty, acolo unde a jucat în 32 de meciuri în toate competițiile interne în chiar primul sezon. De asemenea, în vara lui 2021, Kairat Almaty, cu Mikanovic printre oamenii de bază, a reușit să acceadă în grupele UEFA Conference League. Ulterior, Kairat a fost repartizată în grupa H, alături de Omonia Nicosia, Basel și Qarabag. Din aceste partide, Kairat a obținut două remize, ambele „albe", în fața Omoniei, iar Mikanovic a fost integralist în două din cele șase partide, totalizând peste 400 de minute.

După cei trei ani petrecuți în Kazahstan, Mikanovic s-a întors în țara natală, la echipa pentru care a debutat la seniori, Hajduk Split, în ianuarie 2022. În partea a doua a sezonului 2021-2022 a jucat în 18 meciuri la Hajduk și a marcat o dată, contribuind cu alte două pase decisive, cucerind, de asemenea, Cupa Croației în urma unei finale cu Rijeka (3-1). În stagiunea următoare, Mikanovic a fost om de bază pentru Hajduk, evoluând în 30 de partide în toate competițiile, completate de alte 15 în sezonul 2023-2024.

Doi ani și jumătate a durat revenirea lui Mikanovic la Hajduk, iar în vara anului trecut, acesta s-ar transferat la o altă formație din Croația, HNK Gorica. Pentru aceștia, fundașul dreapta a strâns 32 de meciuri și a reușit să înscrie de două ori. 

Mutarea la ”U” i-a priit instant lui Mikanovic, întrucât internaționalul de tineret croat a făcut parte din Echipa Etapei aleasă de LPF atât la debut (1-1, cu Petrolul), cât și la a doua sa partidă (1-0, cu Farul), când a înscris unicul gol al meciului.